MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium ulcerans AGY99 plasmid pMUM001

Total Repeats: 3471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005916	TG	3	6	149	154	0 %	50 %	50 %	0 %	49146085
2	NC_005916	CGG	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
3	NC_005916	CGC	2	6	189	194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
4	NC_005916	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146085
5	NC_005916	CCA	2	6	276	281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146085
6	NC_005916	GCCTAC	2	12	308	319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	49146085
7	NC_005916	TGC	2	6	338	343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
8	NC_005916	GCC	2	6	347	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
9	NC_005916	CCT	2	6	377	382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146085
10	NC_005916	CA	4	8	498	505	50 %	0 %	0 %	50 %	49146085
11	NC_005916	TAC	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146085
12	NC_005916	GCG	2	6	563	568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
13	NC_005916	CGC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
14	NC_005916	TCG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
15	NC_005916	CCGCAG	2	12	695	706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	49146085
16	NC_005916	GC	3	6	781	786	0 %	0 %	50 %	50 %	49146085
17	NC_005916	TGCT	2	8	809	816	0 %	50 %	25 %	25 %	49146085
18	NC_005916	AAAC	2	8	913	920	75 %	0 %	0 %	25 %	49146085
19	NC_005916	GCCG	2	8	955	962	0 %	0 %	50 %	50 %	49146085
20	NC_005916	CGC	2	6	963	968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
21	NC_005916	CCA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146085
22	NC_005916	GCC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
23	NC_005916	TGC	2	6	1002	1007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
24	NC_005916	GCT	4	12	1009	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
25	NC_005916	CGC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
26	NC_005916	AGCG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	50 %	25 %	49146085
27	NC_005916	GCG	2	6	1078	1083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
28	NC_005916	CGG	2	6	1087	1092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
29	NC_005916	CAG	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146086
30	NC_005916	AGC	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146086
31	NC_005916	TGC	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146086
32	NC_005916	GATC	2	8	1182	1189	25 %	25 %	25 %	25 %	49146086
33	NC_005916	TGC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146086
34	NC_005916	CGC	2	6	1230	1235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146086
35	NC_005916	GCC	3	9	1268	1276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146086
36	NC_005916	TGG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146086
37	NC_005916	TTAC	2	8	1718	1725	25 %	50 %	0 %	25 %	49146087
38	NC_005916	CCT	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146087
39	NC_005916	AGC	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
40	NC_005916	CAA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146087
41	NC_005916	GAA	2	6	1941	1946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146087
42	NC_005916	TCAC	2	8	1966	1973	25 %	25 %	0 %	50 %	49146087
43	NC_005916	ACA	2	6	1978	1983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146087
44	NC_005916	TGG	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146087
45	NC_005916	GCC	2	6	2028	2033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146087
46	NC_005916	GC	3	6	2039	2044	0 %	0 %	50 %	50 %	49146087
47	NC_005916	CGC	2	6	2050	2055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146087
48	NC_005916	CTCG	2	8	2084	2091	0 %	25 %	25 %	50 %	49146087
49	NC_005916	CGA	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
50	NC_005916	CG	3	6	2143	2148	0 %	0 %	50 %	50 %	49146087
51	NC_005916	CAG	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
52	NC_005916	GAC	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
53	NC_005916	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146087
54	NC_005916	CAC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146087
55	NC_005916	TCCT	2	8	2317	2324	0 %	50 %	0 %	50 %	49146088
56	NC_005916	CCT	2	6	2408	2413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146088
57	NC_005916	CGG	2	6	2420	2425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
58	NC_005916	GC	3	6	2444	2449	0 %	0 %	50 %	50 %	49146088
59	NC_005916	CCA	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146088
60	NC_005916	GAT	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49146088
61	NC_005916	CCG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146088
62	NC_005916	GGCC	2	8	2689	2696	0 %	0 %	50 %	50 %	49146088
63	NC_005916	TGCG	2	8	2702	2709	0 %	25 %	50 %	25 %	49146088
64	NC_005916	GGC	2	6	2718	2723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
65	NC_005916	CAG	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146088
66	NC_005916	GGCTG	2	10	2818	2827	0 %	20 %	60 %	20 %	49146088
67	NC_005916	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
68	NC_005916	GAC	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146089
69	NC_005916	ATT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49146089
70	NC_005916	TTC	3	9	3216	3224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146089
71	NC_005916	TCG	2	6	3241	3246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
72	NC_005916	ACA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146089
73	NC_005916	CA	3	6	3394	3399	50 %	0 %	0 %	50 %	49146089
74	NC_005916	GCC	2	6	3402	3407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146089
75	NC_005916	GAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146089
76	NC_005916	CGCCAG	2	12	3479	3490	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	49146089
77	NC_005916	GACG	2	8	3556	3563	25 %	0 %	50 %	25 %	49146089
78	NC_005916	AAC	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146089
79	NC_005916	CGGA	2	8	3593	3600	25 %	0 %	50 %	25 %	49146089
80	NC_005916	GTC	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
81	NC_005916	GC	4	8	3735	3742	0 %	0 %	50 %	50 %	49146089
82	NC_005916	GCG	2	6	3762	3767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146089
83	NC_005916	CCAGC	2	10	3862	3871	20 %	0 %	20 %	60 %	49146089
84	NC_005916	GTC	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
85	NC_005916	ACTT	2	8	5638	5645	25 %	50 %	0 %	25 %	49146090
86	NC_005916	TCG	2	6	5665	5670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
87	NC_005916	CTC	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146090
88	NC_005916	CAC	2	6	5700	5705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146090
89	NC_005916	CGG	2	6	5706	5711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
90	NC_005916	CG	3	6	5731	5736	0 %	0 %	50 %	50 %	49146090
91	NC_005916	CGG	2	6	5739	5744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
92	NC_005916	CCA	2	6	5745	5750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146090
93	NC_005916	CCG	2	6	5751	5756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146090
94	NC_005916	TGGGG	2	10	5811	5820	0 %	20 %	80 %	0 %	49146090
95	NC_005916	TGC	2	6	5851	5856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
96	NC_005916	GGC	2	6	5899	5904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
97	NC_005916	TCG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
98	NC_005916	GCC	2	6	6094	6099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146090
99	NC_005916	CGG	2	6	6122	6127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
100	NC_005916	TTC	2	6	6159	6164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146090
101	NC_005916	GATC	2	8	6218	6225	25 %	25 %	25 %	25 %	49146090
102	NC_005916	CGG	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
103	NC_005916	GCG	2	6	6322	6327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
104	NC_005916	CGG	3	9	6341	6349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
105	NC_005916	GCT	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
106	NC_005916	TGG	2	6	6505	6510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146091
107	NC_005916	TGC	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146091
108	NC_005916	CAT	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146091
109	NC_005916	TCG	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146091
110	NC_005916	TCT	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146092
111	NC_005916	GCTT	2	8	6674	6681	0 %	50 %	25 %	25 %	49146092
112	NC_005916	GCG	2	6	6753	6758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
113	NC_005916	CTC	2	6	6765	6770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146092
114	NC_005916	GCT	3	9	6772	6780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
115	NC_005916	GCG	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
116	NC_005916	CCGGTG	2	12	6787	6798	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	49146092
117	NC_005916	GCC	2	6	6906	6911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146092
118	NC_005916	CGA	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146092
119	NC_005916	GCT	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
120	NC_005916	GGC	2	6	7050	7055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
121	NC_005916	ATC	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146092
122	NC_005916	GCT	2	6	7144	7149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
123	NC_005916	GCCA	2	8	7230	7237	25 %	0 %	25 %	50 %	49146093
124	NC_005916	GTC	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146093
125	NC_005916	TCG	2	6	7308	7313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146093
126	NC_005916	CAG	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146093
127	NC_005916	CCG	2	6	7368	7373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146093
128	NC_005916	GGC	2	6	7401	7406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
129	NC_005916	CGG	2	6	7419	7424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
130	NC_005916	CCG	2	6	7432	7437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146093
131	NC_005916	TGG	2	6	7438	7443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146093
132	NC_005916	GCG	2	6	7492	7497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
133	NC_005916	GC	3	6	7588	7593	0 %	0 %	50 %	50 %	49146093
134	NC_005916	GTG	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146094
135	NC_005916	CGA	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146094
136	NC_005916	GC	3	6	7674	7679	0 %	0 %	50 %	50 %	49146094
137	NC_005916	ACA	2	6	7688	7693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146094
138	NC_005916	CGG	2	6	7772	7777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
139	NC_005916	CCA	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146094
140	NC_005916	GGA	2	6	7816	7821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49146094
141	NC_005916	GCG	2	6	7885	7890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
142	NC_005916	CCA	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146094
143	NC_005916	CG	3	6	8021	8026	0 %	0 %	50 %	50 %	49146094
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157	NC_005916	CGG	2	6	8489	8494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146095
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159	NC_005916	CGA	2	6	8672	8677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146095
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163	NC_005916	CGC	2	6	8960	8965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146095
164	NC_005916	GGT	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146095
165	NC_005916	GC	3	6	8999	9004	0 %	0 %	50 %	50 %	49146095
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170	NC_005916	CGA	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146095
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261	NC_005916	CGG	3	9	12443	12451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146099
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263	NC_005916	CGG	2	6	12489	12494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146099
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265	NC_005916	CAGC	2	8	12545	12552	25 %	0 %	25 %	50 %	49146099
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267	NC_005916	GCCCG	2	10	12667	12676	0 %	0 %	40 %	60 %	49146099
268	NC_005916	CAC	2	6	12779	12784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146100
269	NC_005916	GTG	3	9	12909	12917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146100
270	NC_005916	CGA	2	6	13049	13054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146100
271	NC_005916	TCG	2	6	13077	13082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146100
272	NC_005916	GCC	2	6	13107	13112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146100
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275	NC_005916	CGC	2	6	13156	13161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146100
276	NC_005916	CCG	2	6	13165	13170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146100
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278	NC_005916	GGC	2	6	13223	13228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146100
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289	NC_005916	AGA	2	6	13725	13730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146101
290	NC_005916	TGG	2	6	13736	13741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146101
291	NC_005916	GCG	2	6	13776	13781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146101
292	NC_005916	GTA	2	6	13807	13812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49146101
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302	NC_005916	CG	3	6	14171	14176	0 %	0 %	50 %	50 %	49146102
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344	NC_005916	ACG	3	9	15967	15975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146103
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351	NC_005916	ACA	2	6	16104	16109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146103
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363	NC_005916	AAG	2	6	16414	16419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146103
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381	NC_005916	GAG	2	6	17830	17835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49146106
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384	NC_005916	CGC	2	6	17943	17948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146106
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387	NC_005916	GTG	2	6	18142	18147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146106
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392	NC_005916	AAGG	2	8	18381	18388	50 %	0 %	50 %	0 %	49146106
393	NC_005916	CCG	2	6	18432	18437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146106
394	NC_005916	AACCGG	2	12	18519	18530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146106
395	NC_005916	ACC	2	6	18613	18618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146106
396	NC_005916	CGG	2	6	18795	18800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146107
397	NC_005916	GGGT	2	8	18830	18837	0 %	25 %	75 %	0 %	49146107
398	NC_005916	ATG	2	6	18852	18857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49146107
399	NC_005916	CGG	2	6	18879	18884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146107
400	NC_005916	CAA	2	6	19006	19011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146107
401	NC_005916	AGC	2	6	19034	19039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146107
402	NC_005916	GTT	2	6	19130	19135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49146107
403	NC_005916	CGG	3	9	19167	19175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146107
404	NC_005916	TGT	2	6	19332	19337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49146107
405	NC_005916	GC	3	6	19407	19412	0 %	0 %	50 %	50 %	49146108
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409	NC_005916	GGC	2	6	19701	19706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146108
410	NC_005916	GCT	2	6	19745	19750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146108
411	NC_005916	GCGGGC	2	12	19761	19772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146108
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413	NC_005916	GCT	2	6	19810	19815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146108
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415	NC_005916	GTC	2	6	19855	19860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146108
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473	NC_005916	CAT	2	6	23498	23503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146110
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499	NC_005916	CGG	2	6	24980	24985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146111
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